1、如何使用geo数据库分析基因表达与预后的关系
在NCBI的GEO数据库中,系列(series)中matrix目录下的GSExxx_series_matrix.txt.gz文件,其中的数据是什么含义。是不是别人已经标准化好的数据(而且是log2处理过的),我可以用来直接求倍数然后看表达差异?
GSExxx_series_matrix.txt.gz数据格式和楼主的数据截图类似,差别在于列标题,楼主的列标题是GSMxxxxxx.CEL,而从GEO下载的GSExxx_series_matrix.txt.gz的数据,列标题是GSMxxxxxx,无“.CEL”。
ID_REF GSM413894 GSM413895 GSM413896 GSM413897 GSM413898 GSM413899 GSM413900 GSM413901
AFFX-BioB-3_at 8.472861 7.58379 7.726437 7.808923 8.604332 8.60782 8.343771 8.628157
AFFX-BioB-5_at 8.65537 7.696443 7.996466 7.719412 8.770542 8.652599 8.404749 8.911979
AFFX-BioB-M_at 8.813823 7.890245 8.127718 8.306655 9.011187 8.91993 8.566244 9.06862
AFFX-BioC-3_at 9.633732 9.024885 9.136383 9.120244 10.2995 10.15661 10.00954 10.25113
AFFX-BioC-5_at 9.756588 9.118516 9.137075 9.544678 9.945514 9.793713 9.544567 9.861975
AFFX-BioDn-3_at 12.0726 11.67344 11.62215 11.9874 12.16764 11.97144 11.81811 12.0963
2、肺癌化疗后骨髓抑制怎么办
骨髓抑制是化疗的常见副反应,尤其是多次化疗的患者。建议在医生的指导下一方面进行标准的药物刺激骨髓治疗,另一方面加强营养。
全军肿瘤放疗中心主任,夏廷毅教授提出,肺癌是“3个1/3”:早期肺癌大概占到1/3,中期1/3,真正Ⅵ期肺癌比例更高,甚至能占到40%。
针对某些类型的晚期肺癌患者,可以个体化的选择放射治疗。如果患者是Ⅵ期非小细胞肺癌伴有纵隔淋巴结转移,这个时候可以全身化疗或者靶向治疗,同时要对原发灶、纵膈淋巴结转移灶使用现代放疗技术进行彻底摧毁,同样可以获得长期生存的预后效果。
放疗对于晚期肺癌患者,其实有三种情况。一种是四期早,肺部原发灶和转移灶都小,对病灶实施定点手术或者放疗,同时结合全身化疗或靶向治疗,可以取得较长的生存期。而四期中的患者一般原发灶偏大,纵隔淋巴结有转移,同时转移灶偏多,可以根据情况适当争取把影像可见的病灶全部摧毁,同时结合全身治疗。还有转移灶非常多的四期晚,这时放疗的作用就在于减轻症状,提高患者生活质量。
可以说,Ⅵ期并非死期!Ⅵ期早通过联合化疗或靶向治疗,同时对可见病灶实施根治性放疗,患者的中位生存期是21.8个月,而三期放化疗的中位生存期仅为17个月。且,随着最新TOMO精确放疗技术的开展,对于晚期肺癌的治疗,追求的不仅是“生存”,考虑更多的,是“活着”以后的“质量”:少遭罪、少受苦。
这说明晚期肺癌通过放疗对原发灶、转移灶进行积极参与,有效控制,可以有效提高患者的生存期。
3、白血病是高危基因突变,FLT一3,预后差的基因,经过化疗缓解后做移植,移植成功后对基因突变有关系吗
专业知识未必能够让人清醒!
这个问题很简单:造成基因突变的原因是什么?而移植专的属又是什么?移植器官,而造成基因突变的原因又没有解决的话,一切都是徒劳!所以,这个手术叫做:延长寿命而已!基因何时会再变异,谁都无法估计!但是尽快找出原因才是硬道理!
基因变异有时又要调查祖宗几代,有时也要调查水、食物,周围辐射等!
4、M5 66岁,二次化疗骨髓抑制期,消化道出血,如何应对?
有好些有救治机会的病人,走着进的医院,结果三弄两弄被弄成不治!此为化疗所至胃出血!可以刊出联系,我处可治,中医治疗,治愈后无观察期,不复发。
5、髓母细胞瘤的预后
术后平均生存0.9年,成人的预后较儿童为好。随着近年来临床医学和基础研究的不断专发展,随母细属胞瘤病人的预后得到不断改善。目前多数统计5年存活率均在30%以上,最高统计达80%。个别的可生存达十年以上。Quest认为疗效的提高与术后重视对整个脑与脊髓轴进行放射治疗是分不开的。Bruce认为,最近几年来对儿童髓母细胞瘤的治疗与结果有明显的进步。他新报告的15例中仅1例死亡,且CT扫描证实无肿瘤复发的征象。髓母细胞瘤患者预后与多种因素有关。目前认为手术切除肿瘤的程度与预后密切相关。全切除可明显改善预后,Raimondi认为部分切除和单纯活检其生存率无明显差别。
术后放疗是延长生存期的重要手段,辅助化疗也有一定作用。此外患者年龄与预后也有密切关系,多数文献指出较大年龄的儿童及成人髓母细胞瘤患者的预后较好。应注意的是复发和有转移病例,其预后大大低于第一次治疗,即使使用放疗和化疗,也不会获得满意的疗效。
综上所述,影响预后的因素是多方面的。无疑,彻底切除病灶,术后辅以足够剂量的放疗,有条件配合化疗等综合治疗措施,可能会大大延长髓母细胞瘤患者的生存期和改善病人的生活质量。
6、维持性血液透析患者贫血状况与预后的关系
你好,科莫非治疗维持性血液透析患者肾性贫血的疗效方法治疗组30例采用科版莫非100mg加生理盐水100ml于血液透析结权束后静脉滴注,每周2次,共6周。结论科莫非能迅速有效地纠正接受EPO治疗的维持性血液透析患者的肾性贫血。
7、回顾性队列研究和病例对照研究的区别
回顾性队列研究和病例对照研究的区别:
1.病例对照研究是回顾性的研究,是由果及内因的研究。
先找容到已经发生研究者所关注的疾病(结果)的人作为病例组,再找到有可比性的没有发生该疾病的人做为对照组,调查两组研究对象过去对于研究者所关注的因素(原因)的暴露情况,比较两组的暴露程度,计算两组研究对象暴露比值的差异(OR)。
2.队列研究是前瞻性的,是由因及果的研究。
先找到暴露于研究因素(原因)的人作为暴露组,再找到有可比性的没暴露于研究因素的人作为对照组,随访两组研究对象在未来一定时间内研究者所关注的疾病(结果)的发生情况,比较两组的发病率,计算两组研究对象发病率的比值(RR)。
(7)骨髓抑制期与预后的关系扩展资料:
队列研究优点:
1.资料可靠,一般不存在回忆偏倚。
2.可直接获得暴露组和对照组人群的发病或死亡率,可直接计算RR、AR等反映疾病危险强度的指标。
3.由于病因在前,疾病在后,因此检验假设的能力较强,一般可证实病因联系。
4.有助于了解疾病的自然史,有时还可能获得多种预期以外的疾病结局资料,可分析一因多种疾病的关系。